MARC details
| 000 -LEADER |
|---|
| fixed length control field |
05036nam a22002297a 4500 |
| 003 - CONTROL NUMBER IDENTIFIER |
|---|
| control field |
OSt |
| 005 - DATE AND TIME OF LATEST TRANSACTION |
|---|
| control field |
20190727095827.0 |
| 008 - FIXED-LENGTH DATA ELEMENTS--GENERAL INFORMATION |
|---|
| fixed length control field |
190727b ||||| |||| 00| 0 eng d |
| 040 ## - CATALOGING SOURCE |
|---|
| Transcribing agency |
MSA |
| 082 ## - DEWEY DECIMAL CLASSIFICATION NUMBER |
|---|
| Classification number |
004 |
| 100 ## - MAIN ENTRY--PERSONAL NAME |
|---|
| Personal name |
Yasmeen Abo-Ouf Hamed 163011 |
| 245 ## - TITLE STATEMENT |
|---|
| Title |
Detection of cervical cancer using computational genome assembly // GP // Dr. Ahmed Farouk (2018 - 2019) |
| 260 ## - PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC. |
|---|
| Place of publication, distribution, etc. |
Giza: |
| Name of publisher, distributor, etc. |
MSA, |
| Date of publication, distribution, etc. |
2019. |
| 300 ## - PHYSICAL DESCRIPTION |
|---|
| Extent |
70 p. |
| 440 ## - SERIES STATEMENT/ADDED ENTRY--TITLE |
|---|
| Title |
COMPUTER SCIENCES DISTINGUISHED PROJECTS 2019. |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. |
|---|
| Summary, etc. |
Cervix cancer is one of the deadliest types of cancer in females because it can spread to other<br/>parts in the body damaging them as well. High‑risk Human PapillomaVirus (HPV) infection is<br/>a major cause of cervical cancer. Early detection is one of the most effective methods to combat<br/>cervical cancer. It increases the chances of survival drastically for the patient. High-throughput<br/>sequencing technology is the state of the art techniques for classification problems. With the<br/>development of Next Generation Sequencing (NGS) technologies, DNA sequencing<br/>(DNA‑Seq) has become a powerful tool for analyzing cancer transcriptomes, detecting such<br/>items as alternative splicing, isoform usage, gene fusions and novel transcripts with greater<br/>accuracy and higher efficiency.<br/>This thesis reported transcriptome sequencing analysis of two hundred and ten cervical cancer<br/>tissues and forty-three healthy cervical tissues. All the two hundred and fifty-three samples<br/>examined with before and after trim to produced quality reports, to ensure the quality of the data.<br/>Paired-end fastq files mapped with the reference genome, which is Human PapillomaVirus<br/>(HPV). Through applying backward search with Burrows-Wheeler Transform (BWT) algorithm,<br/>to efficiently align short sequencing reads against a long reference sequence such as the human<br/>genome, allowing mismatches and gaps. The thesis provides a transcriptome landscape of<br/>cervical cancer in Japanese, and Mexican patients and an improved understanding of the genetic<br/>regulatory network in HPV gene annotation. The accuracy is various as that the accuracy for<br/>Mexicans is from 10% to 50%, and Japanese is from 50% to 97%. This thesis tries to detect<br/>cancer before it turns into nodule as early as possible. |
| 520 ## - SUMMARY, ETC. |
|---|
| Summary, etc. |
يعد سرطان عنق الرحم أحد أكثر أنواع السرطان فتكًا في الإناث لأنه يمكن أن ينتشر إلى أجزاء<br/>أخرى من الجسم يضر بها أيضًا. تعد عدوى فيروس الورم الحليمي البشري عالية المخاطر<br/>(HPV) أحد الأسباب الرئيسية لسرطان عنق الرحم. الاكتشاف المبكر هو أحد أكثر الوسائل<br/>فعالية لمكافحة سرطان عنق الرحم. لأنه يزيد من فرص البقاء بشكل كبير للمريض. تقنية<br/>التسلسل عالية الإنتاجية هي أحدث التقنيات لمشاكل التصنيف. مع تطور تقنيات تسلسل الجيل<br/>التالي (NGS) ، أصبح تسلسل الحمض النووي (DNA q Seq) أداة قوية لتحليل نسخ<br/>السرطان ، واكتشاف عناصر مثل الربط البديل ، واستخدام الإسوفورم ، والانصهار الجيني ،<br/>والنصوص الجديدة بدقة أكبر وكفاءة أعلى .<br/>ذكرت هذه الرسالة تحليل تسلسل النسخ من مائتين وعشرة أنسجة سرطان عنق الرحم وثلاثة<br/>وأربعين الأنسجة عنق الرحم صحية. جميع العينات مائتان وثلاثة وخمسين فحصها قبل وبعد<br/>القطع لتقارير الجودة المنتجة ، لضمان جودة البيانات. ملفات fastq المزدوجة نهاية المعينة مع<br/>الجينوم المرجعي ، وهو فيروس الورم الحليمي البشري (HPV). من خلال تطبيق البحث<br/>المتخلف باستخدام خوارزمية Burrows-Wheeler Transform (BWT) ، لمحاذاة<br/>التسلسل القصير يقرأ بفعالية مقابل تسلسل مرجعي طويل مثل الجينوم البشري ، مما يتيح عدم<br/>التطابق والثغرات. تقدم أطروحة المشهد نسخة من سرطان عنق الرحم في المرضى اليابانيين<br/>والمكسيكيين وفهم أفضل للشبكة التنظيمية الجينية في الشرح الجيني فيروس الورم الحليمي<br/>البشري. الدقة مختلفة حيث أن دقة المكسيكيين تتراوح من 10٪ إلى 50٪ ، واليابانية من 50٪<br/>إلى 97٪. تحاول هذه الرسالة اكتشاف السرطان قبل أن يتحول إلى عقيدات في أقرب وقت<br/>ممكن. |
| 650 ## - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Topical term or geographic name entry element |
computational genome assembly |
| 650 ## - SUBJECT ADDED ENTRY--TOPICAL TERM |
|---|
| Topical term or geographic name entry element |
cervical cancer |
| 856 ## - ELECTRONIC LOCATION AND ACCESS |
|---|
| Uniform Resource Identifier |
<a href="https://drive.google.com/drive/folders/1UMuroRUfd84ZscaBFTbxtUiA5JQp_zhF">https://drive.google.com/drive/folders/1UMuroRUfd84ZscaBFTbxtUiA5JQp_zhF</a> |
| Public note |
FULL TEXT HERE |
| 942 ## - ADDED ENTRY ELEMENTS (KOHA) |
|---|
| Source of classification or shelving scheme |
Dewey Decimal Classification |
| Koha item type |
Distinguished Graduation Projects |
